Phần lớn thảm thực vật ban đầu của hòn đảo đã bị khai thác khi hòn đảo được sử dụng làm nhà tù, dễ dàng có thể quan sát các tù nhân trốn chạy. Sau đó, các loài không phải thực vật bản địa, đặc biệt là cây hạt lanh được đưa vào để trồng trợt và đã lan rộng vượt quá tầm soát. Thằn lằn được đưa lên đảo trong một nỗ lực không thành công để kiểm soát loài chuột xâm lấn nhưng sau đó thằn lằn cũng trở thành một vấn đề. Bất chấp mục tiêu đã đề ra là phục hồi môi trường, cừu vẫn tiếp tục được nuôi trên đảo.[5]

Vườn quốc gia này là một vùng đất ngập nước có tầm quan trọng quốc tế bởi nó là nhà của nhiều loài chim tự nhiên quý hiếm và đặc hữu như là Đớp ruồi Noronha, chim nhiệt đới, chim nhiệt đới đuôi trắng, hải âu bồ hóng Audubon.